Une trentaine d'ouvrages franchissent la Seine dans Paris, du bois de Boulogne au périphérique est. Ils appartiennent à toutes les époques, du règne d'Henri IV aux passerelles contemporaines, et leur construction a suivi l'extension de la ville d'une rive à l'autre.

Le Pont Neuf est le plus ancien pont de Paris encore debout, malgré son nom. Commencé sous Henri III et achevé sous Henri IV au début du dix-septième siècle, il franchit la Seine en deux parties, de part et d'autre de la pointe occidentale de l'île de la Cité. Il rompt avec les ponts médiévaux sur deux points : il ne porte aucune maison, ce qui dégage la vue sur le fleuve, et il reçoit des trottoirs surélevés pour les piétons. Ses avancées en demi-lune, qui surmontent les piles, abritaient les marchands ambulants et servent aujourd'hui de points de vue.
Le Pont Alexandre III a été construit pour l'Exposition universelle de 1900, afin de relier l'esplanade des Invalides aux palais édifiés pour l'événement. Sa prouesse tient à son tablier métallique d'une seule arche très surbaissée, destiné à ne pas interrompre la perspective entre le dôme des Invalides et les deux palais de la rive droite. Les groupes sculptés, les candélabres et les pégases dorés qui le décorent en font l'ouvrage le plus orné de Paris. Il porte le nom du tsar dont le fils posa la première pierre, en souvenir de l'alliance franco-russe de la fin du dix-neuvième siècle.
Plusieurs franchissements sont réservés aux piétons. La passerelle des Arts, face à la cour carrée du Louvre, a été le premier pont métallique de Paris au début du dix-neuvième siècle, avant d'être reconstruite dans les années quatre-vingt après plusieurs accidents de navigation. La passerelle Léopold-Sédar-Senghor relie le jardin des Tuileries au musée d'Orsay par un tablier à deux niveaux. La passerelle Simone-de-Beauvoir, inaugurée en 2006 dans l'est de la capitale, relie la Bibliothèque nationale de France au parc de Bercy par une structure en double courbe, sans appui dans le lit du fleuve.
Un pont parisien repose le plus souvent sur des piles fondées dans les alluvions du lit de la Seine, ce qui exige des fondations profondes et une protection contre l'affouillement. Les crues sollicitent ces appuis et y déposent des embâcles, et les chocs de bateaux constituent l'autre risque courant. La Ville et les services de l'État suivent ces ouvrages par des inspections périodiques, avec des campagnes de réparation du tablier, des joints, de l'étanchéité et des garde-corps. Plusieurs de ces ponts sont protégés au titre des monuments historiques, ce qui encadre les travaux et impose le respect des matériaux d'origine.
La hauteur libre sous les arches détermine ce qui peut circuler sur le fleuve dans la traversée de Paris. Les bateaux de passagers à faible tirant d'air sont conçus pour ce gabarit, et leurs timoneries s'abaissent au passage des ouvrages les plus bas. En période de crue, la montée des eaux réduit cette hauteur et conduit à suspendre la navigation, comme les berges basses sont fermées. La statue du zouave adossée à une pile du pont de l'Alma sert depuis le dix-neuvième siècle de repère populaire pour juger du niveau du fleuve, sans valeur de mesure officielle.